La storia narra di un gruppo di cinque ragazzi, i Gowapper Five, capeggiato dalla bionda Yoko Misaki. Naufragati su di un’isola deserta dopo essere passati da un pericoloso tratto di mare squassato da potenti gorghi, vi trovano una grotta, che nasconde una base per la ricerca scientifica. Qui si trova Sentaro Shima, che rivela ai ragazzi l’esistenza di una popolazione di mostri, il Popolo Degli Abissi, che vive nelle viscere della terra, e vuole conquistare il mondo, e di come uno scienziato, il professor Hoarai abbia creato un gigantesco robot di nome Godam per fronteggiarli. Il professore, poco prima di morire, riuscì a trasferire la propria mente nel computer centrale di Godam, divenendone quindi la “mente”. I ragazzi, avendo superato “la prova”, cioè sopravvivere ai gorghi che difendono l’isola, sono quindi pronti a difendere la Terra da questa pericolosa minaccia, grazie al possente robot Godam e all’aiuto del professore, che comunica con loro tramite un ologramma.
